Procurando maior eficiência no estudo de raízes, sistemas computacionais têm sido desenvolvidos para analisar imagens digitais. O ImageJ e o Safira são sistemas de domínio público que podem ser utilizados na análise de raízes lavadas. Porém, supõe-se que há diferenças nos atributos radiculares determinados por meio do ImageJ e Safira. Este estudo foi realizado para comparar valores de comprimento e área superficial de raízes, obtidos com os dois sistemas, com os valores alcançados por meio do método de referência. Amostras de raízes foram coletadas em bananal em áreas de Cambissolo Háplico carbonático típico (CXk), mais raso, e de Cambissolo Háplico Ta eutrófico típico (CXve), mais profundo, em seis camadas e cinco repetições. As raízes foram escaneadas e os sistemas ImageJ e Safira foram utilizados para determinar comprimento e área superficial radicular. Utilizando o método da interseção modificado por Tennant como referência, valores de comprimento e área obtidos pelos sistemas foram analisados a partir do coeficiente de correlação de Pearson e comparados pelo intervalo de confiança e pelo teste t. Ambos os sistemas apresentaram coeficiente de correlação positivo com o método de referência para medidas de comprimento e área superficial em CXk e CXve. O coeficiente de correlação variou de 0,54 a 0,80, com menor valor observado para o ImageJ na determinação da área superficial de amostras coletadas no CXve. O IC (95 %) revelou que as medidas de comprimento radicular com o Safira não diferiram do método de referência no CXk (-77,3 a 244,0 mm). Quanto à área superficial, o Safira não diferiu do método de referência, tanto para amostras coletadas em CXk (-530,6 a 565,8 mm²) como nas provenientes de CXve (-423,1 a 612,1 mm²). Já as medidas feitas com o ImageJ diferiram do método de referência, com valores subestimados de comprimento e área superficial radicular em amostras coletadas em CXk e CXve. Os dois sistemas permitem identificar aumento ou diminuição no comprimento e na área superficial de raízes lavadas. Porém, o Safira resulta em valores de comprimento e de área superficial radicular mais próximos aos obtidos com o método de referência.

In the search for high efficiency in root studies, computational systems have been developed to analyze digital images. ImageJ and Safira are public-domain systems that may be used for image analysis of washed roots. However, differences in root properties measured using ImageJ and Safira are supposed. This study compared values of root length and surface area obtained with public-domain systems with values obtained by a reference method. Root samples were collected in a banana plantation in an area of a shallower Typic Carbonatic Haplic Cambisol (CXk), and an area of a deeper Typic Haplic Ta Eutrophic Cambisol (CXve), at six depths in five replications. Root images were digitized and the systems ImageJ and Safira used to determine root length and surface area. The line-intersect method modified by Tennant was used as reference; values of root length and surface area measured with the different systems were analyzed by Pearson's correlation coefficient and compared by the confidence interval and t-test. Both systems ImageJ and Safira had positive correlation coefficients with the reference method for root length and surface area data in CXk and CXve. The correlation coefficient ranged from 0.54 to 0.80, with lowest value observed for ImageJ in the measurement of surface area of roots sampled in CXve. The IC (95 %) revealed that root length measurements with Safira did not differ from that with the reference method in CXk (-77.3 to 244.0 mm). Regarding surface area measurements, Safira did not differ from the reference method for samples collected in CXk (-530.6 to 565.8 mm²) as well as in CXve (-4231 to 612.1 mm²). However, measurements with ImageJ were different from those obtained by the reference method, underestimating length and surface area in samples collected in CXk and CXve. Both ImageJ and Safira allow an identification of increases or decreases in root length and surface area. However, Safira results for root length and surface area are closer to the results obtained with the reference method.

Atomic Force Microscopy (AFM) can be used to obtain high-resolution topographical images of bacteria revealing surface details and cell integrity. During scanning however, the interactions between the AFM probe and the membrane results in distortion of the images. Such distortions or artifacts are the result of geometrical effects related to bacterial cell height, specimen curvature and the AFM probe geometry. The most common artifact in imaging is surface broadening, what can lead to errors in bacterial sizing. Several methods of correction have been proposed to compensate for these artifacts and in this study we describe a simple geometric model for the interaction between the tip (a pyramidal shaped AFM probe) and the bacterium (Escherichia coli JM-109 strain) to minimize the enlarging effect. Approaches to bacteria immobilization and examples of AFM images analysis are also described.

A produção de uva (Vitis vinifera L.) em termos quantitativos e qualitativos depende do estado das raízes. Além disso, informações sobre a distribuição radicular são úteis para o manejo de solo e água. Por isso, uma análise de métodos para a avaliação da distribuição radicular de videiras cv. Itália / IAC 313 num Latossolo Vermelho Amarelo irrigadas por gotejamento e microaspersão foi realizada em Petrolina – PE e Juazeiro - BA, no Vale do São Francisco. Os parâmetros medidos pelo método do monolito foram a matéria seca (Dw) e densidade de comprimento de raízes (Lv), enquanto a área de raízes (Ap) foi estimada pelo método do perfil de solo combinado com a análise de imagens digitais. Para ambos os sistemas de irrigação, as raízes estiveram presentes até 1 m de profundidade e estenderam-se lateralmente até 1 m de distância do tronco, mas as videiras irrigadas por microaspersão apresentaram uma maior presença de raízes com o aumento da distância do tronco. Os valores de Ap apresentaram uma boa correlação com Dw e Lv, mas essa correlação foi maior quando se utilizou a distribuição fracional de cada parâmetro. O método do perfil auxiliado pela análise de imagem digital permite a avaliação da distribuição radicular.

Grape (Vitis vinifera L.) yield and its quality are dependent of the status of the root system. Root distribution information is also valuable for soil and water management. An analysis of methods to evaluate the root distribution of grapevines for both, drip and microsprinkler irrigation in a Typic Acrustox is presented for the table grape cv. Italia grafted on the rootstock IAC-313, in northeastern Brazil. Measured root parameters using the monolith method were root dry weight (Dw) and root length density (Lv), while root area (Ap) was estimated using the soil profile method in combination with digital image analysis. For both irrigation systems, roots were present to the 1 m soil depth and extended laterally to 1 m distance from the trunk, but grapevines irrigated by microsprinkler showed greater root presence as the distance from the trunk increased. Values of Ap were reasonably well correlated to Dw and Lv. However, correlation values were higher when fractional root distribution was used. The soil profile method in combination with image analysis techniques, allows proper grapevine root distribution evaluation.